Nome: Rayquaza

Jap: Rekku'uza

Tipo: DragoVolante

Abilità: Pressione

Smeraldo: Rayquaza vola incessantemente nello strato d'ozono. Si dice che ritornerebbe a terra se la lotta tra Kyogre e Groudon dovesse riprendere.

HeartGold/SoulSilver: Vive in alto, nello strato di ozono, troppo lontano perché qualcuno l'abbia mai potuto avvistare.

Nell'anime:

Rayquaza appare per la prima volta nel corso del lungometraggio Pokémon: Fratello dallo Spazio. Nel film il Pokémon combatte contro il Pokémon leggendario Deoxys. E' inoltre presente nell'episodio Dove Nessun Togepi è Arrivato Prima! (Where No Togepi Has Gone Before!).

Sfera Verde:

La Sfera Verde (Jade Orb) è uno strumento presente nei videogiochi Pokémon Oro HeartGold e Argento SoulSilver. Al contrario della Sfera Blu e della Sfera Rossa non è quindi presente né nei titoli della terza generazione, né nell'anime Pokémon. L'oggetto, ottenibile dal Professor Oak una volta catturati i Pokémon leggendari Kyogre e Groudon, permette di catturare Rayquaza all'interno della Torre Occulta.

Riparo:

Abilità molto particolare posseduta solamente da Rayquaza, essa rimuove le condizioni meteo sul campo (Pioggia, Sole, Neve). Probabilmente associata a lui perchè dovette far tacere Groudon e Kyogre, eliminando le condizioni meteo e la guerra fra i due.

Nome: Groudon

Jap: Gurādon

Tipo: Terra

Abilità: Siccità

Rubino: La mitologia descriveva Groudon come colui che fa emergere le terre ed espandere i continenti. Questo Pokémon entrò in letargo dopo una lotta contro Kyogre che causò un cataclisma.

HeartGold/SoulSilver: Si tramanda che fece evaporare l'acqua per aumentare la superficie terrestre. Nemico di Kyogre.

Nell'anime: 

 Groudon appare per la prima volta nel corso dell'episodio Team Contro Team (Gaining Groudon). Nella puntata seguente il Pokémon combatte contro il Pokémon leggendario Kyogre. Imitazioni di Groudon sono inoltre presenti in Ash nel Paese delle Meraviglie (Malice in Wonderland!) e nel lungometraggio Pokémon: Jirachi Wish Maker.

Sfera Rossa

La Sfera Rossa (Red Orb) è uno strumento presente nei videogiochi Pokémon Rubino e Pokémon Argento SoulSilver, oltre che nell'anime Pokémon. Nel videogioco della terza generazione ha la proprietà di calmare il Pokémon leggendario, mentre nella versione SoulSilver permette di accedere alla Torre Occulta. Nella serie animata, chi è in possesso della Sfera Rossa è in grado di controllare Groudon.

Siccità:

Abilità molto particolare posseduta solamente da Groudon. Essa posiziona il sole in campo e ha diritto a  soleggiare per tutta la lotta. Unicità perduta nella 5a Generazione, dove a Ninetales viene associta una nuova abilità, quella di Groudon: Siccità. Probabilmente inserita nel set di Groudon per possedere un clima meteo contro il rivale, Kyogre.

Nome: Kyogre

Jap: Kaiōga

Tipo: Acqua

Abilità: Piovischio

Zaffiro: Nella mitologia Kyogre è considerato il Pokémon che ha ingrandito il mare allagando la terra con alluvioni ed enormi maree. Dopo un cataclisma causato dalla sua lotta con Groudon è andato in letargo.

HeartGold/SoulSilver: Nella mitologia, Kyogre è il Pokémon che ha ampliato i mari con megaonde e megapiogge. Nemico di Groudon.

Nell'anime:

 Kyogre appare per la prima volta nel corso dell'episodio Team Contro Team (Gaining Groudon). Nella puntata seguente il Pokémon combatte contro il Pokémon leggendario Groudon. Il Pokémon è inoltre presente nel lungometraggio Pokémon Ranger e il Tempio del Mare.

Sfera Blu:

La Sfera Rossa (Red Orb) è uno strumento presente nei videogiochi Pokémon Rubino e Pokémon Argento SoulSilver, oltre che nell'anime Pokémon. Nel videogioco della terza generazione ha la proprietà di calmare il Pokémon leggendario, mentre nella versione SoulSilver permette di accedere alla Torre Occulta. Nella serie animata, chi è in possesso della Sfera Rossa è in grado di controllare Groudon.

Piovischio:

Abilità particolare posseduta solo da Kyogre. Essa posiziona la pioggia in campo e ha diritto di sostarci per tutta la lotta. Unicità, anch'essa, persa con l'arrivo della 5a Generazione, dove a Politeod viene associata una seconda abilità, quella di Kyogre: Piovischio. Probabilmente inserita nel set di questo pokémon per possedere un clima meteo contro Groudon.

Nome: Regirock

Jap: Rejirokku

Tipo: Roccia

Abilità: Pressione

Smeraldo: Regirock è interamente formato da pietre e rocce. Se qualche roccia si stacca durante la lotta, ne cerca delle nuove per sostituirle.

HeartGold/SoulSilver: I tipi di roccia che compongono il suo corpo possono trovarsi in tutti gli strati geologici del mondo.

Nell'anime:

 Regirock appare per la prima volta nel corso dell'episodio Il Leggendario Ho-Oh (Battling the Enemy Within) di proprietà dell'Asso Baldo. Il Pokémon verrà utilizzato contro l'Hariyama, l'Electabuzz, l'Ursaring,  il Magmar  dell' allenatore Paul. Regirock è inoltre presente nel lungometraggio Pokémon: Lucario e il mistero di Mew.

Nome: Registeel

Jap: Rejisuchiru

Tipo: Acciaio

Abilità: Pressione

Smeraldo: Il corpo metallico di Registeel è costituito da una sostanza misteriosa più dura di qualsiasi altro metallo e al tempo stesso estremamente elastica.

HeartGold/SoulSilver: Ha un corpo più duro di qualunque metallo. Una ricerca ha stabilito che all'interno è cavo.

Nell'anime:

Registeel appare per la prima volta nel corso dell'episodio Un'Infermiera Sorprendente (Overjoyed!) di proprietà dell'Asso Baldo. Il Pokémon verrà utilizzato contro il Magmar ed il Nidoking dell'allenatore Paul. Registeel inoltre presente nel lungometraggio Pokémon: Lucario e il mistero di Mew.

Nome: Regice

Jap: Rejiaisu

Tipo: Ghiaccio

Abilità: Pressione

Smeraldo: Il suo corpo è interamente costituito da ghiaccio antartico che, secondo gli studiosi, si sarebbe formato durante l'era glaciale.

HeartGold/SoulSilver: Si dice che sia rimasto a dormire nei ghiacci per alcuni millenni. Nemmeno il magma riuscirebbe a scioglierlo.

Nell'anime:

Regice appare per la prima volta nel corso dell'episodio Un Incontro Decisivo (Pace - The Final Frontier!) di proprietà dell'Asso Baldo. Il Pokémon verrà utilizzato contro l'Ursaring ed il Lairon dell'allenatore Paul. Regice è inoltre presente nel lungometraggio Pokémon: Lucario e il mistero di Mew.

Nome: Latios

Jap: Ratiosu

Tipo: DragoPsico

Abilità: Levitazione

Zaffiro: Latios apre il proprio cuore ad allenatori d'animo buono e generoso. Il Pokémon riesce a volare più veloce di un aereo a reazione, piegando le zampe anteriori per minimizzare l'attrito dell'aria.

HeartGold/SoulSilver: Dotato di grande intelligenza, capisce il linguaggio umano. Pacifico, non ama combattere.

Latios appare per la prima volta nel corso del lungometraggio Pokémon Heroes. Nel film il Pokémon leggendario si sacrifica per salvare la città di Altomare, trasformandosi in una Gemma dell'Anima. Anche l'allenatore Tobias possiede un esemplare del Pokémon.

Cuorrugiada:

Lo strumento Cuorrugiada (Soul Dew) raddoppia le statistiche Attacco Speciale e Difesa Speciale dei Pokémon Latias e Latios. Nel lungometraggio Pokémon Heroes l'oggetto viene chiamato "Gemma dell'Anima" e contiene l'anima di un Latios

Abbagliante:

Latios è l'unico Pokémon in grado di apprendere la mossa di tipo Psico Abbagliante (Luster Purge).

Similitudini con altri Pokémon:

Latias e Latios sono gli unici due Pokémon di tipo Drago e Psico. Entrambi i Pokémon leggendari sono resistenti agli attacchi d'Acqua, di Fuoco e d'Erba oltre che a quelli elettrici, psichici e del tipo Lotta. Immuni agli attacchi di Terra, sono deboli contro i tipi Coleottero, Spettro, Buio, Ghiaccio e Drago.

Nome: Latias

Jap: Ratiasu

Tipo: DragoPsico

Abilità: Levitazione

Rubino: Latias è sensibilissimo alle emozioni delle persone. Se percepisce una certa ostilità, questo Pokémon arruffa le piume su tutto il corpo ed emette un grido lancinante per intimidire il nemico.

HeartGold/SoulSilver: Sa comunicare telepaticamente. Le piume sul suo corpo riflettono la luce e lo rendono invisibile.

Nell'anime:

                     Latias appare per la prima volta nel corso del lungometraggio Pokémon Heroes.                             

Foschisfera:

Latias è l'unico Pokémon in grado di apprendere la mossa di tipo Psico Foschisfera (Mist Ball)

Similitudini con altri Pokémon:

Latias e Latios sono gli unici due Pokémon di tipo Drago e Psico. Entrambi i Pokémon leggendari sono resistenti agli attacchi d'Acqua, di Fuoco e d'Erba oltre che a quelli elettrici, psichici e del tipo Lotta. Immuni agli attacchi di Terra, sono deboli contro i tipi Coleottero, Spettro, Buio, Ghiaccio e Drago.

Nome: Deoxys

Jap: Deokishisu

Tipo: Psico

Abilità: Pressione

Smeraldo: Deoxys è la mutazione di un virus extraterrestre colpito da un raggio laser. La sua struttura corporea gli conferisce agilità e velocità superiori.

HeartGold/SoulSilver: Una mutazione di virus alieni ha portato alla creazione di questo Pokémon. Visibile in prossimità dell'aurora

...Deoxys possiede delle statistiche eccezionali, superbe, esse possono essere cambiate utilizzando la sua particolarità: Quella di cambiare forma e aspetto, le quali possono sbilanciarsi enormemente....

Ecco, illustrate, tutte le forme di Deoxys

Attacco

Difesa

Velocità

Alla destra è possibile, nuovamente, ammirare le forme di Deoxys, la novità è il retro dello sprite (Bianco/Nero)

Essi, corrispondono esattamente alla forma a cui sono incolonnati.

Deoxys appare per la prima volta nel corso del lungometraggio Pokémon: Fratello dallo Spazio. Nel film il Pokémon assume un ruolo da protagonista ed ingaggia una battaglia contro il Pokémon leggendario Rayquaza.Poiché la pellicola è stata distribuita prima del videogioco Pokémon Smeraldo, Deoxys è visibile solamente nelle forme Normale, Attacco e Difesa. Nell'episodio Un Deoxys in Crisi (Pokémon Ranger - Deoxys Crisis!) Deoxys è presente anche nella forma Velocità. In Dispersi sull'Isola Deserta! (Cheers on Castaways Isle!) è presente in tutte le sue forme.

Psicolancio:

Deoxys è l'unico Pokémon in grado di apprendere naturalmente la mossa Psicoslancio (Psycho Boost). L'attacco, di tipo Psico, può essere utilizzato anche dal Pokémon leggendario Lugia, se questi viene purificato nel videogioco Pokémon XD: Tempesta Oscura.

Nome: Jirachi

Jap: Jirāchi

Tipo: PsicoAcciaio

Abilità: Leggiadro

Smeraldo: Si dice che Jirachi possa realizzare qualsiasi desiderio. Mentre dorme, protegge il suo corpo all'interno di un duro guscio cristallino.

HeartGold/SoulSilver: Da sempre si dice che al risveglio realizzi i desideri scritti sulle striscioline attaccate in testa

Nell'anime:

 Jirachi appare per la prima volta nel lungometraggio Pokémon: Jirachi Wish Maker, in cui assume un ruolo da protagonista.

Obbliderio:

Jirachi è l'unico Pokémon in grado di utilizzare la mossa di tipo Acciaio Obbliderio (Doom Desire). La Potenza e la Precisione dell'attacco sono aumentati nel corso della quinta generazione.